Raziskovalci zagotavljajo nove podatke o tridimenzionalni strukturi genoma

Ponedeljek, 24. junij 2013. - Znanstveniki iz Avstralije in Združenih držav Amerike zagotavljajo novo znanje o razumevanju tridimenzionalne strukture genoma, ki je eden največjih izzivov, s katerimi se trenutno spopada področje genomike in genetike, katere sklepe objavlja v svoji digitalni izdaji. " Naravna genetika “.

Približno tri metre DNK je tesno zloženih v jedru vsake celice našega telesa, kar omogoča, da se nekateri geni "izrazijo" ali aktivirajo, razen drugih. Zdravniki Tim Mercer in John Mattick z inštituta za medicinska raziskovanja Garvan iz Sydneyja in profesor John Stamatoyannopoulos z univerze Washington v Seattlu sta z visoko ločljivostjo analizirali 3D strukturo genoma.
Geni so sestavljeni iz "eksonov" in "intronov", prvi so zaporedja, ki kodirajo in izražajo beljakovine, zadnji pa se raztezajo nekodirajoče DNK v mediju. Ko se geni kopirajo ali prepisujejo, se iz DNA v RNK intronske sekvence razrežejo ali "zlepijo", preostali eksoni pa so vezani skupaj, da tvorijo zaporedje, ki kodira protein. Odvisno od eksonov, ki se jih skenira, lahko isti gen ustvari različne beljakovine.
Dr. Tim Mercer in njegovi sodelavci so z uporabo velikih količin podatkov iz projekta ENCODE sklepali zgibanje genoma in ugotovili, da so tudi znotraj gena izbrani eksoni zlahka izpostavljeni. "Predstavljajte si dolgo in neizmerno zapleteno trto, njene zvite veje, ki predstavljajo nekaj grozdja, ki ga je mogoče enostavno odtrgati, druge pa skrivati ​​zunaj njihovega dosega, " postavlja primer. Mercer
"Hkrati si predstavljajte, da leni nabiralci sadja samo nabirajo grozdje na dosegu roke - dodaja. - Enako načelo velja za genom. Določeni geni in celo specifični eksoni so postavljeni v dosegu zlaganja." V tem smislu ta raziskovalec poudarja, da so znanstveniki v zadnjih letih začeli ceniti, kako zlaganje genomov pomaga določiti, kako se izraža in uravnava.
"Ta študija daje prvi pokazatelj, da lahko tridimenzionalna struktura genoma vpliva na spajanje genov. Lahko sklepamo, da se genom zloži tako, da se promocijsko območje, zaporedje, ki iniciira transkripcijo gena, najdemo poleg eksonov in vsi so odpeljani v stroje za prepisovanje, "poudarja.
"To podpira nov način gledanja na stvari, da se genom upogiba okoli strojev za prepisovanje, ne pa obratno. Ti geni, ki pridejo v stik s stroji za prepisovanje, dobijo kopije, medtem ko deli, ki krožijo daleč stran jih ignoriramo, «zaključi ta raziskovalec.
Vir: www.DiarioSalud.net